[BioRuby-ja] Bio::Alignment::EnumerableExtension#consensus
遠藤大二
dendoh @ rakuno.ac.jp
2007年 7月 26日 (木) 07:05:07 UTC
遠藤です 何度もすみません。MultipleFastaFormatのファイルをMafftで解析することも出来ました。
それから、rdocを見て自助努力をしまして、MultiFastaFormatのオブジェクトにするところまでは出来ました。
ただ、MultiFastaFormatからEnumerableExtensionモジュールを使ってconsensus
sequenceを作成することが出来ません。下記のコードに対して修正コメントいただけないでしょうか。
data=File.read('multifasta.fasta')
ffa=Bio::Alignment::MultipleFastaFormat.new(data)
ffconsensus=Bio::Alignment::EnumerableExtension.consensus_string(ffa)
よろしくお願いします。
BioRuby-ja メーリングリストの案内