[BioRuby-ja] get_genes_by_enzymeコマンドについて

[Toshiaki Katayama]

川島さん

ktym ＠ samma:~% cat moge.rb
#!/usr/local/bin/ruby

require 'bio'
serv = Bio::KEGG::API.new
p serv.get_genes_by_enzyme('ec:1.1.1.1', 'eco')

ktym ＠ samma:~% ruby moge.rb
["eco:b0356", "eco:b1241", "eco:b1478", "eco:b3589"]

再現できないのですが、同じ現象は続いていますか？

片山


On 2006/11/23, at 4:55, Takeshi Kawashima wrote:

> biorubyメーリングリストの皆様
>
> いつもお世話になります。
> EC番号からgenesのIDのリストが欲しいのですけれども、
> 下記スクリプトに対して、空のアレイが返って来てしまいます。
> なにがおかしいのでしょうか。
> なお、他のKEGG APIのメソッドは現在の環境で、上手く動いています。
> biorubyは1.8.5、(使っているのは、東大のsammaサーバーです。)
>
>  川島武士
>
> スクリプト
>
> #!/usr/local/bin/ruby
>
> require 'bio'
> serv = Bio::KEGG::API.new
> p serv.get_genes_by_enzyme('ec:1.1.1.1', 'eco')
>
> 返ってくるメッセージ
>
> bash-2.03$ ruby hoge.rb
> WSDLDriverFactory#create_driver is depricated.  Use create_rpc_driver
> instead.
> []