[BioRuby-ja] get_genes_by_enzymeコマンドについて
Takeshi Kawashima
kawashima38 @ gmail.com
2006年 11月 22日 (水) 19:55:00 UTC
biorubyメーリングリストの皆様
いつもお世話になります。
EC番号からgenesのIDのリストが欲しいのですけれども、
下記スクリプトに対して、空のアレイが返って来てしまいます。
なにがおかしいのでしょうか。
なお、他のKEGG APIのメソッドは現在の環境で、上手く動いています。
biorubyは1.8.5、(使っているのは、東大のsammaサーバーです。)
川島武士
スクリプト
#!/usr/local/bin/ruby
require 'bio'
serv = Bio::KEGG::API.new
p serv.get_genes_by_enzyme('ec:1.1.1.1', 'eco')
返ってくるメッセージ
bash-2.03$ ruby hoge.rb
WSDLDriverFactory#create_driver is depricated. Use create_rpc_driver
instead.
[]
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