[BioRuby-ja] bioruby version 1.0.0について

川島 武士 kawashima_38 @ hotmail.com
2006年 4月 29日 (土) 05:16:21 UTC


biorubyメーリングリストの皆様

カリフォルニア大学バークレー校の川島です。
(アドレスを、変更しました。)

 最近、v.1.0.0に変更したのですが、変更がいろいろあったようで、
すこし戸惑っています。

たとえば、なにかfastaのファイルを次のプログラムにわたすと

#!/usr/local/bin/ruby

require 'bio'
include Bio

ff = FlatFile.new(FastaFormat, ARGF)
ff.each do |x|
  puts x
end

/usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:118:in `pos': no stream to 
tell (ArgumentError)
        from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:118:in `pos'
        from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:342:in 
`get_entry'
        from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:573:in 
`next_entry'
        from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:609:in `each'
        from hoge.rb:7

と、エラーがでてしまいます。
どこを修正すればよろしいでしょうか?
(bioruby-0.6.4にもどすと、エラーがでなくなります。)

 よろしくお願いします。

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