[BioRuby-ja] bioruby version 1.0.0について
川島 武士
kawashima_38 @ hotmail.com
2006年 4月 29日 (土) 05:16:21 UTC
biorubyメーリングリストの皆様
カリフォルニア大学バークレー校の川島です。
(アドレスを、変更しました。)
最近、v.1.0.0に変更したのですが、変更がいろいろあったようで、
すこし戸惑っています。
たとえば、なにかfastaのファイルを次のプログラムにわたすと
#!/usr/local/bin/ruby
require 'bio'
include Bio
ff = FlatFile.new(FastaFormat, ARGF)
ff.each do |x|
puts x
end
/usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:118:in `pos': no stream to
tell (ArgumentError)
from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:118:in `pos'
from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:342:in
`get_entry'
from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:573:in
`next_entry'
from /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/bio/io/flatfile.rb:609:in `each'
from hoge.rb:7
と、エラーがでてしまいます。
どこを修正すればよろしいでしょうか?
(bioruby-0.6.4にもどすと、エラーがでなくなります。)
よろしくお願いします。
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