[BioRuby-ja] New library for Simple Interaction File

2005年 5月 23日 (月) 22:45:43 EDT

後藤さん

にかいどうです。

コメントありがとうございます。

あ、Bio::Pathway をちゃんとみてませんでした。
Bio::SIFは包含されそうですので、SIFの入出力に
関するメソッドなりを用意するのがよいかもしれませんね。

考えてみます。

On 2005/05/23, at 17:52, GOTO Naohisa wrote:

> ざっと見たところ、
>   SIF クラス              -- SIF全体のデータ構造
>   SIF::Interaction クラス -- 枝(相互作用)の 
> データ
> のクラスが存在するわけですね。
>
> Bio::Relation や Bio::Pathway との関係はどうすればいいで 
> しょうか？
> 違う概念のものなので独立したままでいいか、何らかの形で統合する 
> か、
> 変換するメソッドを用意するか、等々。

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二階堂愛, Ph.D. <itoshi ＠ saitama-med.ac.jp> / http://itoshi.tv/
埼玉医科大学  ゲノム医学研究センター  ゲノム科学部門
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