[Biojava-l] Get a sequence from internet
Dickson S. Guedes
guedes at unisul.br
Mon Apr 3 15:09:43 UTC 2006
Yes,
Hi Anderson,
You can use the NCBISequenceDB:
(...)
NCBISequenceDB ncbiDB = new NCBISequenceDB();
Sequence sequenceFromGenbank = ncbiDB.getSequence("sequence_id");
System.out.println(sequenceFromGenbank.getName());
(...)
Change "sequence_id" for a ID from Genbank.
:)
Anderson Moura da Silva escreveu:
> Is possible to get a sequence from one of the sources on the internet, like from the Swissprot, using biojava?
>
> Can anybody help?
>
> Thanks,
>
>
> Esta mensagem, incluindo seus anexos, pode conter informações privilegiadas e/ou de caráter confidencial, não podendo ser retransmitida sem autorização do remetente. Se você não é o destinatário ou pessoa autorizada a recebê-la, informamos que o seu uso, divulgação, cópia ou arquivamento são proibidos. Portanto, se você recebeu esta mensagem por engano, por favor, nos informe respondendo imediatamente a este e-mail e em seguida apague-a.
>
>
> _______________________________________________
> Biojava-l mailing list - Biojava-l at lists.open-bio.org
> http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/biojava-l
>
--
Dickson S. Guedes
/*
* UNISUL - Universidade do Sul de Santa Catarina
* ATI - Assessoria de Tecnologia da Informação
* (0xx48) 621-3200 - http://www.unisul.br
*
* "Quis custodiet ipsos custodes?"
*/
More information about the Biojava-l
mailing list