[MOBY-dev] [moby] Try to create service from serialized WSDL, get strange SOAP::Lite error

Mark Wilkinson markw at illuminae.com
Tue Feb 7 19:43:21 UTC 2006


Hi Frank, 

I've read over your bug report below a few times and I can't quite
extract from it what the bug actually is...  Can you paraphrase?

thanks, 

M



On Fri, 2006-02-03 at 12:41 -0500, Frank Gibbons wrote:
>    Hi,
>    It takes MOBY about half a second to retrieve WSDL from Central, to build a
>    service. In an effort to improve performance in an application that may need
>    to build many (maybe ten) services at a time, I'm trying to cache WSDL
>    locally, and build services from that, as needed. I'm using Storable for
>    serialization  in  Perl,  which has worked well for me in the past. To
>    paraphrase Yogi Berra: "Half a second here, half a second there, pretty soon
>    you're talking about real time."
>    I'm encountering a strange error in this, which appears to be emanating
>    ultimately from SOAP::Lite (see below) In essence it says:
>    Service description 'data:,<insert_wsdl_here> can't be loaded: 501 Protocol
>    scheme '' is not supported
>    The WSDL is URI_encoded by MOBY, not by me - I just supply an XML-text
>    description to MOBY::Client::Service->new(), pretty much exactly as provided
>    from MCentral. I DO NOT see this problem when using the WSDL supplied by
>    MOBY Central directly however, so there's clearly some kind of problem with
>    serialization. I'm wondering if any of you have seen a similar behaviour in
>    the past, and how you got around it. The WSDL I retrieve from the cache
>    looks fine when I print it out, but I'm wondering if there might be some
>    other funkiness to it that gets messed up with I store it.
>    Thanks in advance.
>    -Frank
>    ==============================   MOBY::Client::Service  message  below
>    =========================
>    Service description
>    'data:,%3C%3Fxml%20version%3D%221.0%22%3F%3E%0A%3Cwsdl%3Adefinitions%20name%
>    3D%22MOBY_Central_Generated_WSDL%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%2
>    0%20%20%20targetNamespace%3D%22http%3A%2F%2Fbiomoby.org%2FCentral.wsdl%22%0A
>    %20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xmlns%3Atns%3D%22http%3A%2F%
>    2Fbiomoby.org%2FCentral.wsdl%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20
>    %20%20xmlns%3Axsd1%3D%22http%3A%2F%2Fbiomoby.org%2FCentralXSDs.xsd%22%20%0A%
>    20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xmlns%3Asoap%3D%22http%3A%2F%
>    2Fschemas.xmlsoap.org%2Fwsdl%2Fsoap%2F%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%2
>    0%20%20%20%20%20xmlns%3Axsd%3D%22http%3A%2F%2Fwww.w3.org%2F1999%2FXMLSchema%
>    22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xmlns%3D%22http%3A%2F%2
>    Fschemas.xmlsoap.org%2Fwsdl%2F%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%
>    20%20%20xmlns%3Awsdl%3D%22http%3A%2F%2Fschemas.xmlsoap.org%2Fwsdl%2F%22%3E%0
>    A%0A%20%20%0A%20%20%3Cwsdl%3Amessage%20name%3D%22ASimpleServiceInput%22%3E%0
>    A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Apart%20name%3D%22data%22%20type%3D%
>    22xsd%3Astring%22%2F%3E%0A%20%20%3C%2Fwsdl%3Amessage%3E%0A%20%20%20%20%20%20
>    %20%20%0A%20%20%3Cwsdl%3Amessage%20name%3D%22ASimpleServiceOutput%22%3E%0A%2
>    0%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Apart%20name%3D%22body%22%20type%3D%22x
>    sd%3Astring%22%2F%3E%0A%20%20%3C%2Fwsdl%3Amessage%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20
>    %20%20%20%0A%20%20%3Cwsdl%3AportType%20name%3D%22ASimpleServicePortType%22%3
>    E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Aoperation%20name%3D%22ASimpleSer
>    vice%22%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Ain
>    put%20message%3D%22tns%3AASimpleServiceInput%22%2F%3E%0A%20%20%20%20%20%20%2
>    0%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Aoutput%20message%3D%22tns%3AASimple
>    ServiceOutput%22%2F%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3C%2Fwsdl%3Aoperatio
>    n%3E%0A%20%20%3C%2Fwsdl%3AportType%3E%0A%20%0A%20%20%3Cwsdl%3Abinding%20name
>    %3D%22ASimpleServiceBinding%22%20type%3D%22tns%3AASimpleServicePortType%22%3
>    E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Csoap%3Abinding%20style%3D%22rpc%22%20tr
>    ansport%3D%22http%3A%2F%2Fschemas.xmlsoap.org%2Fsoap%2Fhttp%22%2F%3E%0A%20%2
>    0%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Aoperation%20name%3D%22ASimpleService%22%3
>    E%3C!--%20in%20essense%2C%20this%20is%20the%20name%20of%20the%20subroutine%2
>    0that%20is%20called%20--%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%
>    20%20%3Csoap%3Aoperation%20soapAction%3D'http%3A%2F%2Fbiomoby.org%2F%23ASimp
>    leService'%20style%3D'rpc'%2F%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%2
>    0%20%20%20%3Cwsdl%3Ainput%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20
>    %20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Csoap%3Abody%20use%3D%22encoded%22%20namespa
>    ce%3D%22http%3A%2F%2Fbiomoby.org%2F%22%20encodingStyle%3D%22http%3A%2F%2Fsch
>    emas.xmlsoap.org%2Fsoap%2Fencoding%2F%22%2F%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20
>    %20%20%20%20%20%20%20%20%3C%2Fwsdl%3Ainput%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%
>    20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Aoutput%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%
>    20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Csoap%3Abody%20use%3D%22encode
>    d%22%2F%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3C%2Fwsdl%3
>    Aoutput%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3C%2Fwsdl%3Aoperation%3E%0A%20%2
>    0%3C%2Fwsdl%3Abinding%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%
>    0A%20%20%3Cwsdl%3Aservice%20name%3D%22ASimpleServiceService%22%3E%0A%20%20%2
>    0%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Adocumentation%3EAuthority%3A%20llama.med.har
>    vard.edu%20%20-%20%20A%20simple%20service%20for%20testing%20purposes.%0AEnte
>    r%20or%20edit%20the%20description%20of%20service%20ASimpleService.%0A%0A%3C%
>    2Fwsdl%3Adocumentation%3E%20%20%3C!--%20service%20description%20goes%20here%
>    20--%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cwsdl%3Aport%20name%3D%22ASimpleSe
>    rvicePort%22%20binding%3D%22tns%3AASimpleServiceBinding%22%3E%0A%20%20%20%20
>    %20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%3Csoap%3Aaddress%20location%3D%22htt
>    p%3A%2F%2Fllama.med.harvard.edu%2F~fgibbons%2Fcgi%2FBGN%2Fdispatcher.pl%22%2
>    F%3E%20%20%20%20%3C!--%20URL%20to%20service%20scriptname%20--%3E%0A%20%20%20
>    %20%20%20%20%20%20%20%3C%2Fwsdl%3Aport%3E%0A%20%20%3C%2Fwsdl%3Aservice%3E%0A
>    %0A%3C%2Fwsdl%3Adefinitions%3E%0A%0A%0A' can't be loaded: 501 Protocol
>    scheme '' is not supported
> 
>    PhD, Computational Biologist,
>    Harvard Medical School BCMP/SGM-322, 250 Longwood Ave, Boston MA 02115, USA.
>    Tel: 617-432-3555       Fax:
>    617-432-3557       [1]http://llama.med.harvard.edu/~fgibbons
> 
> References
> 
>    1. http://llama.med.harvard.edu/~fgibbons
> _______________________________________________
> MOBY-dev mailing list
> MOBY-dev at biomoby.org
> http://biomoby.org/mailman/listinfo/moby-dev
-- 
--
...his last words were 'Hey guys!  Watch this!'
--
Mark Wilkinson
Asst. Professor
Dept. of Medical Genetics
University of British Columbia
PI in Bioinformatics
iCAPTURE Centre
St. Paul's Hospital
Rm. 166, 1081 Burrard St.
Vancouver, BC, V6Z 1Y6
tel: 604 682 2344 x62129
fax: 604 806 9274

"For most of this century we have viewed communications as a conduit, 
       a pipe between physical locations on the planet. 
What's happened now is that the conduit has become so big and interesting 
      that communication has become more than a conduit, 
       it has become a destination in its own right..."

                Paul Saffo - Director, Institute for the Future




More information about the MOBY-dev mailing list