[BioRuby-ja] color_pathway_by_objects で色分けしたい

myomoto akira akira_myomoto @ yahoo.co.jp
2007年 10月 30日 (火) 07:35:29 UTC


東レ株式会社の妙本です。


color_pathway_by_objectsを使ったpathwayの色分けにおいて、
1つのEC番号に2つ以上のentryがある場合、どちらが優先されま
すか?

具体的には
path:hsa00380のEC1.14.14.1にhsa:1543とhsa:11283が対応
する中で、hsa:11283の色を優先して表示したいと思っています。
良い方法があればご教授下さい。

次のスクリプトは同じ結果になってしまいます。
require 'bio'
serv = Bio::KEGG::API.new
obj_list = ['hsa:11283','hsa:1543']
fg_list  = ['green','black']
 bg_list  = ['blue','red']
url = serv.color_pathway_by_objects('path:hsa00380',obj_list,fg_list,bg_list)
serv.save_image(url, "out1.gif")

obj_list = ['hsa:1543','hsa:11283']
 fg_list  = ['black','green']
  bg_list  = ['red','blue']
 url = serv.color_pathway_by_objects('path:hsa00380',obj_list,fg_list,bg_list)
 serv.save_image(url, "out2.gif")
 
よろしくお願いします。 

 
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