[BioRuby-ja] Bio::PubMed.queryはobsolete？

[MISHIMA, Hiroyuki]

三嶋＠Univ of Iowaと申します

Biorubyを便利に使わせていただいております。開発コミュニティーの皆様には
深く感謝しております。

さて，最近，昔から使っていたPubMedからBibtexエントリを出力するcgi（http:
//misshie.jp/pm2bibtex/）が動かなくなったので調べたところ，

Version : BioRuby 1.1.0 / Ruby 1.8.5
bioruby> Bio::PubMed.query(12345)
  ==> ""

のようになっているようです。単に，Bio::Pubmed.pmfetch()に差し替えるだけ
で問題解決しました。

すでにBio::PubMed.query()はobsoleteであり，今後はNCBI推奨のE-UTIL経由の
pmfetch/efetchを使う，という理解でよろしいでしょうか？

（もしFAQなら失礼しました）

三嶋博之

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MISHIMA, Hiroyuki, DDS, Ph.D.
Postdoctoral Research Scholar
Dr. Andrew C. Lidral Lab.,
Dows Institute for Dental Research.,
College of Dentistry, University of Iowa
PGP-FP: A7BC 8963 44E5 2AE1 DEA8 34B1 6F3A CD79 D00D 260F