[BioRuby-ja] 複数ファイル順次読み込み

[Daiji Endoh]

酪農学園大の遠藤と申します。



以前に、Hotmailのアドレスで登録させていただき、可能なコドンの読み枠全てをリ
ストアップする方法について教えていただきました。その際には、せっかくのご教示
を生かすことができず、申し訳ありませんでした。



その後、Hotmailへのアクセスがなぜかできなくなってしまい、自宅のプロバイダー
のアドレスで登録しなおしました。またよろしくお願いします。



今度は、大変に基本的でお恥ずかしい質問ですが、どうしても必要なのに対し、全く
できないもので、質問させていただきます。



今、20個の複数(10-1000)のレコードを含むGenbankファイルをMySQLに取り込んで処
理しようとしております。



ff=Bio::FlatFile.new(Bio::GenBank, ARGF)

ff each_entry ….



というチュートリアルにある方法で処理していますが、今後もファイル数が増えそう
なので、ファイルのリストを配列かなにかで記録しておき、自動的に取り込むように
したいのです。



このARGFのところはオブジェクトと考え、



filename=File.open(“hoge.gb”)

filename=File.read(“hoge gb”)



ff=Bio::FlatFile.new(Bio::GenBank, filename)



としてみましたが、うまくいきません。



あまりにも初歩的な質問で申し訳ありませんが、なにとぞやり方を教えてください。



よろしくお願いします。