
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">

<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>

</head>

<body dir="ltr">

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Hi all,</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

I’ve opened GitHub issue #5100 proposing a new module, Bio.SeqUtils.PeptideDescriptors, to compute advanced descriptors for amino acid sequences (e.g., Kidera, Atchley, FASGAI). These are widely used in QSAR modelling, anticancer peptide screening, and clustering;

 however, Biopython currently supports only basic properties, such as molecular weight and pI.</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

I’d be happy to prototype this with unit tests and documentation if there’s interest. Would others find this useful, and are there particular descriptor sets you’d prioritise?</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Best,</div>

<pre class="elementToProof"><div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">Anoop (GitHub: flyfir248)</div></pre>

<div style="font-family: "Baskerville Old Face"; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

</body>

</html>