<div><br></div><div><div dir="auto">FYI, I’ve seen some recent continuous integration failures likely linked to setuptools v50.0.0 - might affect Biopython too?</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">---------- Forwarded message ---------<br>From: <strong class="gmail_sendername" dir="auto">Ralf Gommers</strong> <span dir="auto"><<a href="mailto:ralf.gommers@gmail.com">ralf.gommers@gmail.com</a>></span><br>Date: Wed, 2 Sep 2020 at 11:34<br>Subject: [Numpy-discussion] setuptools/distutils merger & numpy.distutils<br>To: Discussion of Numerical Python <<a href="mailto:numpy-discussion@python.org">numpy-discussion@python.org</a>><br></div><br><br><div dir="ltr"><div>Hi all,</div><div><br></div><div>I spent some time looking at the fallout of the setuptools 50.0 release. There's quite a few small issues, those can/should all be worked around by pinning setuptools to a lower version. <br></div><div><br></div><div>The root cause and main longer-term issue is that numpy.distutils extends and monkeypatches distutils, which mostly was fine because distutils moved super slowly and had a decent QA process. Now with setuptools, any patch goes into master and gets released to the whole wide world without any testing. The summary of that and how to deal with it I posted on <a href="https://github.com/pypa/setuptools/issues/2372" target="_blank">https://github.com/pypa/setuptools/issues/2372</a> for discussion.</div><div><br></div><div>Cheers,<br></div><div>Ralf</div><div><br></div></div><br><br>_______________________________________________<br><br>NumPy-Discussion mailing list<br><br><a href="mailto:NumPy-Discussion@python.org" target="_blank">NumPy-Discussion@python.org</a><br><br><a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/numpy-discussion" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailman/listinfo/numpy-discussion</a><br><br></div></div>