<div dir="ltr">Hi Peter et al. <div><br></div><div>Very happy to add the BSD 3-clause license, and makes sense to have the CONTRIB info point to my github. <br><br></div><div>Thanks,</div><div>David</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Tue, Dec 18, 2018 at 11:23 PM Peter Cock <<a href="mailto:p.j.a.cock@googlemail.com">p.j.a.cock@googlemail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear David,<br>
<br>
Back in 2009 you kindly made a couple of contributions to Biopython's<br>
EMBOSS wrappers (and some test cases too, and documentation IIRC):<br>
<br>
<a href="https://github.com/biopython/biopython/commit/f04c083482899a4ec330cae2fad158dc6f0fd131" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/biopython/commit/f04c083482899a4ec330cae2fad158dc6f0fd131</a><br>
<br>
<a href="https://github.com/biopython/biopython/commit/d9e8972b3956e4c30dc7afd9049dc13283865b60" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/biopython/commit/d9e8972b3956e4c30dc7afd9049dc13283865b60</a><br>
<br>
Would you agree to dual license all your contributions to Biopython<br>
under the user's choice of the current "Biopython License Agreement"<br>
and the standard "BSD 3-Clause License"? A reply to our public<br>
mailing list or as comment on this GitHub issue would suffice as a<br>
public record: <a href="https://github.com/biopython/biopython/issues/898" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/biopython/issues/898</a><br>
<br>
Thank you,<br>
<br>
Peter<br>
<br>
P.S. I see you are now on GitHub, so on a related note, may I<br>
update your CONTRIB listing entry to point there?<br>
<br>
<a href="https://github.com/dwinter" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/dwinter</a><br>
<br>
On Tue, Sep 1, 2009 at 11:38 PM David Winter<br>
<<a href="mailto:winda002@student.otago.ac.nz" target="_blank">winda002@student.otago.ac.nz</a>> wrote:<br>
><br>
><br>
> > David - I would prefer we also put your new wrappers in<br>
> > Bio.Emboss.Applications, and would be happy to look at adding<br>
> > those to CVS now that Biopython 1.51 is out (I had forgotten<br>
> > about them actually - so thanks for the reminder).<br>
> ><br>
> > Peter<br>
><br>
> Hi Peter,<br>
><br>
> I'd almost forgotten about them myself! I only put them in their own<br>
> module because I had the PhyML wrapper as well and that's not an<br>
> EMBOSS application.<br>
><br>
>   I suspect a wrapper for PhyML is probably not going to be widely<br>
> useful (a normal run lasts at least several hours and most people will<br>
> want to look over their alignments by eye before they set it off). So<br>
> I'll move the phylip ones into Emboss.Applications and gather a few<br>
> thoughts about other phylogenetic software including PhyML and see<br>
> what the dev list thinks about them.<br>
><br>
> david<br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> Biopython mailing list  -  <a href="mailto:Biopython@lists.open-bio.org" target="_blank">Biopython@lists.open-bio.org</a><br>
> <a href="http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython</a><br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div>David Winter<br>Postdoctoral Research Fellow<br><div>Institute of Fundamental Sciences</div><div><div>Massey University</div><div>Palmerston North 4442</div></div><div>New Zealand</div><br>ph: +64 <span style="font-size:12.8px">0204 119 2692</span></div><div>w: <a href="http://www.david-winter.info" target="_blank">www.david-winter.info</a><br>lab: <a href="http://cartwrig.ht/lab/" target="_blank">http://massey.genomicus.com/</a><br>blog: <a href="http://sciblogs.co.nz/the-atavism" target="_blank">sciblogs.co.nz/the-atavism</a></div></div></div>