<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Hi all,</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">I have a virtual environment with python 2.7.15rc1 and I get this error when I run some commands:</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">////</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div><i>Python 2.7.15rc1 (default, Apr 15 2018, 21:51:34) </i></div>
<div><i>[GCC 7.3.0] on linux2</i></div>
<div><i>Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.</i></div>
<div><i>>>> from Bio import SeqIO</i></div>
<div><i>Traceback (most recent call last):</i></div>
<div><i>  File "<stdin>", line 1, in <module></i></div>
<div><i>  File "Bio/SeqIO/__init__.py", line 375, in <module></i></div>
<div><i>    from Bio.Align import MultipleSeqAlignment</i></div>
<div><i>  File "Bio/Align/__init__.py", line 22, in <module></i></div>
<div><i>    from Bio.Align import _aligners</i></div>
<div><i>ImportError: cannot import name _aligners</i></div>
<div><br>
</div>
////
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">I've made sure to run "python setup.py build" before trying anything but that did not solve the problem.</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">I'm on Ububtu 18.04 on a virtual machine.</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Thanks,</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Francesco</p>
</div>
<br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
</body>
</html>