<div dir="ltr">I am trying to extract metadata, specifically things like temperature range and oxygen requirement status, for a large list of organisms. I am having trouble accomplishing this by searching the genome database using either efetch or esummary. No matter the route I take, it appears I end up with the "docsum" version of data. As an example, I am searching for the genome id# 13296. If I search the genome database on NCBI's website, I get a results page corresponding to a page ending with ".../genome/?term=13296", which often contains my desired metadata. But when using the Entrez module, I get results corresponding to ".../genome/?term=13296&report=docsum", which contains pretty bare-bones level of information.<div><br></div><div>Here is an example of what I have tried and the result:</div><div><br><div>>>>record=Entrez.esummary(gb="genome,id="13296")</div></div><div>>>>Entrez.read(record)</div><div>[{'Number_of_Organelles': '0', 'Number_of_Plasmids': '0', 'Create_Date': '2012/03/29 00:00', 'ProjectID': '157423', 'Assembly_Accession': 'GCA_000284295.1', 'Number_of_Chromosomes': '1', 'Options': '', 'DefLine': 'Actinoplanes missouriensis overview', u'Item': [], 'Organism_Kingdom': 'Bacteria', 'Assembly_Name': 'ASM28429v1', 'AssemblyID': '408138', 'Organism_Name': 'Actinoplanes missouriensis', u'Id': '13296'}]<br></div><div><br></div><div><br></div><div>I have tried playing with rettype="full", retmode="text" and the like, as well as using efetch instead of esummary, but regardless I only get this more limited set of data. Is there a different approach I should be taking here? Thank you very much for any pointers.</div><div><br>Kirk</div></div>