<div dir="ltr"><div>Dear All.</div><div>I would like to get the similarity between two sequences, I have found that there is attributes called "similarity" but I this it is boolean value, is there any way to get the similarity value between two sequences instead of writing a text file.</div><div><br></div><div>from Bio.Emboss.Applications import WaterCommandline</div><div>water_cmd = WaterCommandline(gapopen=10, gapextend=0.5)</div><div>water_cmd.asequence = "asis:ACCCGGGCGCGGT"</div><div>water_cmd.bsequence = "asis:ACCCGAGCGCGGT"</div><div>print water_cmd.similarity</div><div>> None</div><div><br></div>
</div>