<div dir="ltr">I did something similar with complete genbank files.  What worked for me was just appending to the same file for each run.<div><br></div><div>Damian</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Dec 2, 2015 at 12:39 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:c.buhtz@posteo.jp" target="_blank">c.buhtz@posteo.jp</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I asked the Entrez support how should I tread the servers resources<br>
with "respect". :)<br>
<br>
First answer was without discrete numbers but in the second one they<br>
told me asking for 500 (retmax for eSearch) is a "reasonable" value<br>
because the eBot (a tool they offer on their website) use it, too.<br>
<br>
No I have nearly 13.000 PIDs I want to fetch their article infos via<br>
eFetch. It is a lot. ;)<br>
<br>
But I am not sure how to do that with biopython. When I separate that<br>
in 500-packages I would have 26 different record objects back.<br>
I don't like that. I would prefer one big record object I can analyse.<br>
<br>
Do you see a way to merge this record objects. Or maybe there is<br>
another way for that?<br>
Or does Biopython.Entrez still handle that problem internal (like the<br>
only-3-per-second-querys-rule or the HTTP-POST-decision)?<br>
<br>
Any suggestions?<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888">--<br>
GnuPGP-Key ID 0751A8EC<br>
_______________________________________________<br>
Biopython mailing list  -  <a href="mailto:Biopython@mailman.open-bio.org">Biopython@mailman.open-bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython</a><br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2">Damian Menning, Ph.D.</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2">"There are two types of academics. Those who use the Oxford comma, those who don't and those who should."</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2">Standard comma - You know Bob, Sue and Greg? They came to my house.</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" size="2">Oxford comma - </font><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">You know Bob, Sue, and Greg? They came to my house.</span></div><div><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">Walken Comma - </span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">You know, Bob, Sue, and Greg? They came, to my house.</span></div><div><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">Shatner comma - </span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">You, know, Bob, Sue, and Greg? They, came, to my house.</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>