<div dir="ltr">Hi Patrick,<div><br></div><div>The PDB format is historically written in uppercase but there is nothing in the format definition that states it should be so.. </div><div><br></div><div>A quick fix for your problem, and I think we can safely add it to the main code, is to change the PDBParser.py file at line 214 to <span style="background-color:rgb(255,229,153)"><font face="monospace, monospace">element = line[76:78].strip().upper()</font></span>. Then just rebuild and re-install Biopython and it should parse your PDB files correctly.</div><div><br></div><div>Alternatively, we can just add the upper() call to line 136, which should fix this and any other &#39;case&#39; issues.</div><div><br></div><div>What do others think?</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>João</div></div>