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Hi, do you guys know any good literature reference that provides a reliable equation to determine the ideal step temperatures and durations for a PCR given the primers and the amplicon?<BR>

<BR>

I see annealing temps can be calculated with biopython via <A HREF="https://github.com/biopython/biopython/blob/master/Bio/SeqUtils/MeltingTemp.py">SeqUtils.MeltingTemp,</A> which is nice, but it would be even greater if we could provide assistance with designing more of the PCR protocol. I am asking this also because I have a set of new primers over here which likely need a new thermocycler protocol, and all I found via google was very vague.<BR>

<BR>

BEst,<BR>

Christian 

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