
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 TRANSITIONAL//EN">

<HTML>

<HEAD>

  <META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; CHARSET=UTF-8">

  <META NAME="GENERATOR" CONTENT="GtkHTML/4.8.5">

</HEAD>

<BODY>

Hi, I am trying to use NCBIWWW. I find it difficult to figure out what the possible database names are. I understand that this is where the NCBI BLAST databases are stored: <A HREF="ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/">ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/</A><BR>

<BR>

and some of those IDs work... But why for instance will mouse_genomic_transcript not work? the only other mouse alternative is mouse_est (which works), but that only gives me expressed genes - I'd like to use NCBI's BLAST against the whole mouse genome and only the mouse genome from biopython. Can I do this?<BR>

<BR>

Many Thanks,<BR>

Christian 

</BODY>

</HTML>