<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">

<!--

p

        {margin-top:0;

        margin-bottom:0}

-->

P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">

<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">Hi,<br>

<br>

I have a query re BLAST output. I have written a BioPython script that takes the attached betl gene sequence and runs a blast. It returns results for Listeria monocytogenes WSLC1001 complete genome with gi|584465821|gb|CP007160.1.<br>

<br>

I run the same from the NCBI web interface just to verify the output and it also returns this result.

<br>

<br>

However why is it that it does not return the correct match of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome with gi|16802048:2172068-2173591 as we can see at the top of the attached fasta file?<br>

<br>

Thanks in advance<br>

Aisling.<br>

</div>

</div>

</body>

</html>