<div dir="ltr">Hi Patrick,<div><br></div><div>RMSD and RMS, in protein structure comparison, are the same thing. RMS is just &quot;root mean square&quot; while RMSD is the more &quot;correct&quot; term: RMS deviation.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>João</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2014-10-03 18:13 GMT+02:00 PC <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:patrick.cossins@inbox.com" target="_blank">patrick.cossins@inbox.com</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I am confused, what is the difference between RMSD and RMS?<br>
<br>
In protein papers they cite RMSD but biopython returns RMS.<br>
<br>
Thank you,<br>
Patrick<br>
<br>
____________________________________________________________<br>
Can&#39;t remember your password? Do you need a strong and secure password?<br>
Use Password manager! It stores your passwords &amp; protects your account.<br>
Check it out at <a href="http://mysecurelogon.com/manager" target="_blank">http://mysecurelogon.com/manager</a><br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Biopython mailing list  -  <a href="mailto:Biopython@mailman.open-bio.org">Biopython@mailman.open-bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython</a><br>
</blockquote></div><br></div>