<div dir="ltr">Thanks for the explanation.<div><br></div><div>Note I have sometimes needed to *filter* a SwissProt</div><div>format file, and you can do this via SeqIO's index</div><div>get_raw functionality (grab the original raw record</div><div>as a string, and save it to a file as is). There's an</div><div>example of this in our Tutorial, see the section</div><div>"Getting the raw data for a record":</div><div><br></div><div><a href="http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html">http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html</a><br></div><div><br></div><div>Peter</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Dec 25, 2017 at 4:05 PM, Adam Sjøgren <span dir="ltr"><<a href="mailto:asjo@koldfront.dk" target="_blank">asjo@koldfront.dk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">Peter writes:<br>
<br>
> I don't recall anyone asking about this, so there doesn't seem to be<br>
> much need for it. And perhaps because of this, no one has ever<br>
> written the code to do it. I've only ever needed to read these files.<br>
><br>
> Why do you need Swiss aka SwissProt aka UniProt DAT format<br>
> output?<br>
<br>
</span>I guess we should just use GenBank format.<br>
<br>
Traditionally (which in this case means: using BioPerl) we have been<br>
using SwissProt format when writing protein records, so I was just<br>
trying to do the same in BioPython, without any deeper thought going<br>
into it :-)<br>
<br>
<br>
  Thanks for the reply & merry christmas,<br>
<br>
    Adam<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
 "There are forty people in the world and five of them        Adam Sjøgren<br>
  are hamburgers."                                       <a href="mailto:asjo@koldfront.dk">asjo@koldfront.dk</a><br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Biopython-dev mailing list<br>
<a href="mailto:Biopython-dev@mailman.open-bio.org">Biopython-dev@mailman.open-<wbr>bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/<wbr>mailman/listinfo/biopython-dev</a></div></div></blockquote></div><br></div>