<div dir="ltr"><div><div>Great,<br></div>I want to comment this weekend, if it will have not been merged at that time yet.<br><br></div>Jun<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 15, 2017 at 5:39 PM, Peter Cock <span dir="ltr"><<a href="mailto:p.j.a.cock@googlemail.com" target="_blank">p.j.a.cock@googlemail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Would anyone like to comment on Francesco's pull request:<br>
<br>
<a href="https://github.com/biopython/biopython/pull/1298" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/<wbr>biopython/pull/1298</a><br>
<br>
This is to add a wrapper for EBI's dbfetch, originally logged as:<br>
<br>
<a href="https://github.com/biopython/biopython/issues/443" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/<wbr>biopython/issues/443</a><br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Peter<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, Jun 21, 2017 at 12:06 PM, Peter Cock <<a href="mailto:p.j.a.cock@googlemail.com">p.j.a.cock@googlemail.com</a>> wrote:<br>
> CC biopython-dev for the module naming in particular.<br>
><br>
> General feedback or ideas about supporting the EBI's web-interface<br>
> (their REST API, similar to the NCBI's Entrez utilities, or TogoWS)<br>
> are welcome here or on the GitHub issue:<br>
><br>
> <a href="https://github.com/biopython/biopython/issues/443" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/<wbr>biopython/issues/443</a><br>
><br>
> Peter<br>
><br>
> On Wed, Jun 21, 2017 at 11:25 AM, Francesco Gastaldello (Staff)<br>
> <<a href="mailto:f.gastaldello@dundee.ac.uk">f.gastaldello@dundee.ac.uk</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Hi all,<br>
>><br>
>> this mail regard the development on my behalf for the dbfetch wrapper. More info on the service are here: <a href="http://www.ebi.ac.uk/Tools/dbfetch/dbfetch" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ebi.ac.uk/Tools/<wbr>dbfetch/dbfetch</a><br>
>><br>
>> There is already an issue on the Biopython GitHub (#443) were me and Peter Cock are discussing how to place the module when it's going to be ready.<br>
>><br>
>> He mentioned the possibility to place it in Bio/EBI/__init__.py, but he's concened that this won't comply with PEP8 guidelines.<br>
>><br>
>> Any thoughts about it?<br>
>><br>
>> Regards,<br>
>><br>
>> Francesco<br>
>><br>
>> Dbfetch < EMBL-EBI<br>
>> <a href="http://www.ebi.ac.uk" rel="noreferrer" target="_blank">www.ebi.ac.uk</a><br>
>> Dbfetch Help. What is dbfetch? Dbfetch is an abbreviation for "database fetch". Dbfetch provides an easy way to retrieve entries from various databases at the EMBL ...<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Biopython-dev mailing list<br>
<a href="mailto:Biopython-dev@mailman.open-bio.org">Biopython-dev@mailman.open-<wbr>bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/<wbr>mailman/listinfo/biopython-dev</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Jun Aruga<div><br></div></div></div>
</div>