<div dir="ltr">Hi Peter, everyone,<div><br></div><div>The pull request solves a longstanding bug, specific to the Exonerate parser but it does not alter the behaviour of the rest of the module (per our tests). I would actually be more comfortable removing the experimental warning after the pull request (or a variation of it, depending on feedback) has been merged. It is intended to make the module more stable after all.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Bow</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Aug 11, 2016 at 1:31 PM Christian Brueffer <<a href="mailto:christian@brueffer.de" target="_blank">christian@brueffer.de</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Peter,<br>
<br>
certainly, I'll have a look at the release instructions.<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
Chris<br>
<br>
<br>
On 2016-08-11 11:14, Peter Cock wrote:<br>
> Dear Biopythoneers,<br>
><br>
> The NCBI plan to switch to HTTPS on 1 September 2016, so it<br>
> would be good to get a new Biopython release out before that<br>
> with the changes to use HTTPS by default (which we know<br>
> works).<br>
><br>
> To that end, I would like us to do the Biopython 1.68 release<br>
> this month (August), perhaps aiming for next week?<br>
><br>
> Christian - we talked briefly about this at BOSC 2016 - but<br>
> would you be willing to try to work though the currently release<br>
> instructions (as far as possible without pushing any changes<br>
> to GitHub or PyPI) to help pin point what I have left unclear<br>
> with the recent website changes?<br>
><br>
> <a href="http://biopython.org/wiki/Building_a_release" rel="noreferrer" target="_blank">http://biopython.org/wiki/Building_a_release</a><br>
><br>
> Ben - would you be able to build the Windows installers<br>
> again please?<br>
><br>
> Bow - are you ready to remove the experimental warning<br>
> from Bio.SearchIO? Or at least, most of it - I know you have<br>
> some changes in mind for the Exonerate parser:<br>
> <a href="https://github.com/biopython/biopython/pull/815" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/biopython/pull/815</a><br>
><br>
> Everyone - is there anything urgent we need to review and<br>
> merge? What am I overlooking? There are lots of pull<br>
> requests we could merge, and some are close to ready.<br>
><br>
> Thanks,<br>
><br>
> Peter<br>
><br>
_______________________________________________<br>
Biopython-dev mailing list<br>
<a href="mailto:Biopython-dev@mailman.open-bio.org" target="_blank">Biopython-dev@mailman.open-bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev</a><br>
</blockquote></div></div>