<div dir="ltr">Hi Peter <div><br></div><div>Thanks so much for welcoming me and for taking the time to guide me on things I can start helping with. </div><div><br></div><div>Indeed, there are many tasks I can help with without working on the code itself - it's also a fabulous (gentle) way to get oriented with the various repositories.</div><div><br></div><div>I'll get started and sure to reach out to you/group whenever I have questions.</div><div><br></div><div>The first (possibly few) commits will be likely trivial - intentionally so, just so that I get familiar with the workflow of making/committing a change and seeing it through to deployment. Hoping it's not seen annoying or inconvenient to folks involved.</div><div><br></div><div>Warm Regards</div><div>Mahesh</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 18, 2016 at 5:53 PM, Peter Cock <span dir="ltr"><<a href="mailto:p.j.a.cock@googlemail.com" target="_blank">p.j.a.cock@googlemail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Mahesh,<br>
<br>
Saying hello on this mailing list is very appropriate. Welcome!<br>
<br>
Right now we've been busy with rebuilding the website using<br>
GitHub pages - you've found the repository for that - have a<br>
look at the issue tracker or just looking glitches in the website<br>
would  be a good way to immediately help out.<br>
<br>
(If this side of things happens to particularly interest you,<br>
then the websites for BioSQL, BioJava, and BioPerl have<br>
been though a similar migration - I'm currently doing BioDAS<br>
and there are a couple more to look at after that).<br>
<br>
On the testing side, Tiago has been looking at making it easier<br>
for us to make sure we're testing all our code with "soft" or<br>
optional dependencies. We're using TravisCI but haven't yet<br>
got that working under Mac OS X too - nor have we setup a<br>
similar system for Windows testing but such things exist.<br>
<br>
We do have a buildbot setup as well, <a href="http://testing.open-bio.org" rel="noreferrer" target="_blank">testing.open-bio.org</a>,<br>
but do need another volunteer with a Windows machine...<br>
<br>
API documentation wise, we're still using epydoc to build<br>
the API doc webpages from our docstrings, see:<br>
<br>
<a href="http://biopython.org/wiki/Building_a_release" rel="noreferrer" target="_blank">http://biopython.org/wiki/Building_a_release</a><br>
<br>
All our docstrings *should* now be valid restructured text.<br>
A next step would be to replac epydoc (and its ugly HTML<br>
output) with something like Sphinx, pandoc, or the hosted<br>
service <a href="http://readthedocs.org" rel="noreferrer" target="_blank">readthedocs.org</a><br>
<br>
Rather than scaring you (and anyone else reading this), I'm<br>
trying to say there's lots of things that can be worked on<br>
even without working directly on the code itself - so I hope<br>
there's something that looks interesting that you'll try.<br>
<br>
And please do ask questions,<br>
<br>
Thanks!<br>
<br>
Peter<br>
<div><div class="h5"><br>
On Wed, May 18, 2016 at 9:32 PM, Mahesh Gudapakkam<br>
<<a href="mailto:mahesh.gudapakkam@gmail.com">mahesh.gudapakkam@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hi All,<br>
><br>
> I have a feeling this may not be the right way to offer that I'd like to<br>
> help with contributing to Biopython but I am doing so per this text on your<br>
> website. (<a href="http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#htoc319" rel="noreferrer" target="_blank">http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#htoc319</a> -<br>
>  The best place to express an interest is on the Biopython mailing lists –<br>
> just let us know you are interested in coding and what kind of stuff you<br>
> want to work on.)<br>
><br>
> I am Web developer and UI/UX designer who is very interested in<br>
> Bioinformatics. Ideally I'd like to contribute to modules within Biopython<br>
> but I know that will take time and domain expertise. I will get there.<br>
><br>
> However, I'd like to begin immediately by offering to help with the website,<br>
> documentation and unit tests.  At present, I am reviewing both Chapter 22<br>
> Where to go from here – contributing to Biopython as well as your github<br>
> repo for your website <a href="https://github.com/biopython/biopython.github.io" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/biopython/biopython.github.io</a>.<br>
><br>
> Please let me know if this is the right way to get involved with this<br>
> effort. My apologies if I did this the wrong way.<br>
><br>
> Thanks<br>
> Mahesh Gudapakkam<br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Biopython-dev mailing list<br>
> <a href="mailto:Biopython-dev@mailman.open-bio.org">Biopython-dev@mailman.open-bio.org</a><br>
> <a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev</a><br>
</blockquote></div><br></div>