<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><font face="verdana, sans-serif"><br></font><div class="gmail_quote"><font face="verdana, sans-serif">On Thu, Jan 14, 2016 at 6:44 AM, Peter Cock <span dir="ltr"><<a href="mailto:p.j.a.cock@googlemail.com">p.j.a.cock@googlemail.com</a>></span> wrote:<br></font><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div class="" style="overflow:hidden"><font face="verdana, sans-serif">Thanks Tiago,<br>
<br>
Was any of this version of python specific?</font></div></blockquote></div><font face="verdana, sans-serif"><br></font><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><br class="">Good question, I have to assume the tutorials worked when they were written. My impression is that the issues are not a result of any specific cause, like Python 3, rather a result of the tutorial going stale as the project moved along. I have not been around to what so can't really say.</font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif">The cluster tutorial has very little code that can be run, but it is a good tutorial of clustering.</font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif">Why have separate documentation/tutorial/cookbook here?</font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><a href="http://biopython.org/wiki/Documentation">http://biopython.org/wiki/Documentation</a>  (<span style="color:rgb(0,0,0);line-height:19.2px">Wiki documentation section)</span><br></font></div><div class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0);line-height:19.2px"><font face="verdana, sans-serif">and</font></span></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><font color="#000000"><span style="line-height:19.2px"><a href="http://biopython.org/wiki/Category:Cookbook">http://biopython.org/wiki/Category:Cookbook</a></span></font><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000" face="verdana, sans-serif"><span style="line-height:19.2px"><br></span></font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000" face="verdana, sans-serif"><span style="line-height:19.2px"><br></span></font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><font color="#000000"><span style="line-height:19.2px">What I think would be cool. Static Jupiter notebooks as documentation (think nbviewer <a href="http://nbviewer.ipython.org/">http://nbviewer.ipython.org/</a>) with a link to launch the notebook into a</span></font><span style="line-height:19.2px;color:rgb(0,0,0)"> Live executable jupyter notebook, see: <a href="https://lambdaops.com/ipythonjupyter-tmpnb-debuts/">https://lambdaops.com/ipythonjupyter-tmpnb-debuts/</a>  Or just export as .py  or more boring pdf/html</span></font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif">Since I think this would be cool I have been working to making this happen, Any thoughts?</font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default"><font face="verdana, sans-serif">I have been busy with a few other projects recently, hope to get back to this soon.</font></div><font face="verdana, sans-serif"><br clear="all"></font><div><div class="gmail_signature"><div><font face="verdana, sans-serif">Vincent Davis</font></div><br></div></div>
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