<div dir="ltr">Iddo,<br><div><br></div><div>I wrote a CD-HIT parser, as well as a dnaclust parser, and a general API for sequence based clustering. I do intended to submit it to biopython but I've been too busy.</div><div><br></div><div>Maybe that would be of interest to you? Or we could work on it together?</div><div><br></div><div>-krish</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Nov 12, 2015 at 12:28 PM Iddo Friedberg <<a href="mailto:idoerg@gmail.com">idoerg@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Would there be an interest in a CD-HIT parser contributed to biopython? Is someone working on one right now?<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div>Iddo Friedberg<br><a href="http://iddo-friedberg.net/contact.html" target="_blank">http://iddo-friedberg.net/contact.html</a><br>++++++++++[>+++>++++++>++++++++>++++++++++>+++++++++++<<<<<-]>>>>++++.><br>++++++..----.<<<<++++++++++++++++++++++++++++.-----------..>>>+.-----.<br>.>-.<<<<--.>>>++.>+++.<+++.----.-.<++++++++++++++++++.>+.>.<++.<<<+.>><br>>>----.<--.>++++++.<<<<------------------------------------.<br></div>
</div>
_______________________________________________<br>
Biopython-dev mailing list<br>
<a href="mailto:Biopython-dev@mailman.open-bio.org" target="_blank">Biopython-dev@mailman.open-bio.org</a><br>
<a href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biopython-dev</a></blockquote></div>