<div><br></div><div><div><br></div><div><br></div><div style="font-size: 12px;font-family: Arial Narrow;padding:2px 0 2px 0;">------------------&nbsp;Original&nbsp;------------------</div><div style="font-size: 12px;background:#efefef;padding:8px;"><div><b>From: </b>&nbsp;"bioperl-l-request";&lt;bioperl-l-request@mailman.open-bio.org&gt;;</div><div><b>Date: </b>&nbsp;Mon, Apr 20, 2015 08:00 PM</div><div><b>To: </b>&nbsp;"bioperl-l"&lt;bioperl-l@mailman.open-bio.org&gt;; <wbr></div><div></div><div><b>Subject: </b>&nbsp;Bioperl-l Digest, Vol 144, Issue 6</div></div><div><br></div>Send Bioperl-l mailing list submissions to<br>        bioperl-l@mailman.open-bio.org<br><br>To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>        http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/bioperl-l<br>or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>        bioperl-l-request@mailman.open-bio.org<br><br>You can reach the person managing the list at<br>        bioperl-l-owner@mailman.open-bio.org<br><br>When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>than "Re: Contents of Bioperl-l digest..."<br><br><br>Today's Topics:<br><br>&nbsp;&nbsp; 1.&nbsp; Problem Installing Bio::DB::EUtilities (Warren Gallin)<br><br><br>----------------------------------------------------------------------<br><br>Message: 1<br>Date: Sun, 19 Apr 2015 13:37:25 -0600<br>From: Warren Gallin &lt;wgallin@ualberta.ca&gt;<br>To: BioPerl List &lt;Bioperl-l@mailman.open-bio.org&gt;<br>Subject: [Bioperl-l] Problem Installing Bio::DB::EUtilities<br>Message-ID: &lt;D0F7DD50-C606-4D8C-8706-8DAED1A27C98@ualberta.ca&gt;<br>Content-Type: text/plain; charset=utf-8<br><br>After a machine crash I have had to install all my software anew, using OS X 10.10.3 on a brand new macBook Pro.<br><br>I was able to install BioPerl, but when I have tried to install Bio::DB::EUtilities I consistently get the following failure after the tests are run:<br>??????????????????????????????????????????????????????????????????????????<br><br>[clipped]<br><br>All tests successful.<br>Files=21, Tests=756,&nbsp; 3 wallclock secs ( 0.13 usr&nbsp; 0.04 sys +&nbsp; 2.91 cusr&nbsp; 0.47 csys =&nbsp; 3.55 CPU)<br>Result: PASS<br>&nbsp; CJFIELDS/Bio-EUtilities-1.73.tar.gz<br>Tests succeeded but one dependency not OK (inc::TestHelper)<br>&nbsp; CJFIELDS/Bio-EUtilities-1.73.tar.gz<br>&nbsp; [dependencies] -- NA<br>Failed during this command:<br>&nbsp;CJFIELDS/Bio-EUtilities-1.73.tar.gz&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; : make_test NO one dependency not OK (inc::TestHelper)<br><br><br>???????????????????????????????????????????????????????????<br><br>inc::Test is not, as far as I can tell, a separate module, but rather something internal to Bio::DB::EUtilities<br><br>So my question is, how do I get Utilities installed so I can access NCBI data?<br><br>Warren Gallin<br><br><br><br><br>------------------------------<br><br>_______________________________________________<br>Bioperl-l mailing list<br>Bioperl-l@mailman.open-bio.org<br>http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/bioperl-l<br><br>End of Bioperl-l Digest, Vol 144, Issue 6<br>*****************************************<br></div>