<div dir="ltr">Solved.&nbsp;<div>Thanks.<br><br>On Friday, February 27, 2015 at 4:26:23 PM UTC-3, Thiago Venancio wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>Bio::Search::Tiling::MapTiling frac_identical() is calculating it over the total query length instead of the aligned length in a a BLASTN. Below is the code I am using:<br></div><div><br></div><div><font face="courier new, monospace" color="#0000ff">while( my $hit = $result-&gt;next_hit ) {<br></font></div><div><div><font face="courier new, monospace" color="#0000ff">&nbsp; &nbsp; &nbsp;my $tiling = Bio::Search::Tiling::<wbr>MapTiling-&gt;new($hit);</font></div></div><div><div><span style="color:rgb(0,0,255);font-family:'courier new',monospace;font-size:13px">&nbsp; &nbsp; &nbsp;my $id = $tiling-&gt;frac_identical(-type =&gt; 'query', -action =&gt; 'exact');</span><br></div></div><div><font face="courier new, monospace" color="#0000ff">}</font></div><div><br></div><div>Does anyone know how to change this behavior ?</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Thiago</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div></blockquote></div></div>