<div dir="ltr"><div>Hi all,</div><div>I am parsing a BLASTX report and got the following error for some sequences.</div><div>It always happen with sub-sequences of 1 base. I found some posts on this issue, but they are old.</div><div>I am use the lates version installed through apt-get.</div><div>Any help is appreciated.</div><div>Thiago</div><div><br></div><div>------------- EXCEPTION: Bio::Root::Exception -------------</div><div>MSG: Undefined sub-sequence (241,242). Valid range = 96 - 242</div><div>STACK: Error::throw</div><div>STACK: Bio::Root::Root::throw /usr/share/perl5/Bio/Root/Root.pm:472</div><div>STACK: Bio::Search::HSP::HSPI::matches /usr/share/perl5/Bio/Search/HSP/HSPI.pm:716</div><div>STACK: Bio::Search::SearchUtils::_adjust_contigs /usr/share/perl5/Bio/Search/SearchUtils.pm:431</div><div>STACK: Bio::Search::SearchUtils::tile_hsps /usr/share/perl5/Bio/Search/SearchUtils.pm:201</div><div>STACK: Bio::Search::Hit::GenericHit::frac_aligned_hit /usr/share/perl5/Bio/Search/Hit/GenericHit.pm:1319</div><div><br></div></div>