<div dir="ltr"><div>I&#39;m trying to index a large fasta file that I downloaded from NCBI&#39;s ftp site. The size of the fasta file is 700GB. I&#39;m trying to use Bio::DB::Fasta to index this file. When the index file hits around 10GB, it seems to hang. I&#39;m wondering if there is a limit on the fasta file size it can index.<br>
<br></div><div>Also, how does Bio::DB::Fasta compare to Bio::Index::Fasta? Is one better for large fasta files? Are there any other indexing schemes I can use instead of these modules? Any information would be appreciated.<br>
</div><div><br>Thanks,<br><br></div>KB<br></div>