<div dir="ltr"><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><br>Thanks, it's working but we have some concerns because the alt locs property refers to an atom property and we cannot understand why you decided to associate  this property to a group of atoms.<br></blockquote><div><br></div><div>I understand the confusion. It is how things were designed in BioJava a long time ago. In any case data standards for alt locs are not very well specified. Different depositors can use alt locs in different ways.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<br>
For instance, in the pdb 4KL8 the alternative conformation is reported for the FCO group, how can I identify just the alternative conformation of the iron ion?<br></blockquote><div><br></div><div>I think you can identify and get the alternative conformation for one atom only with code similar to what I shared, right? Could you elaborate what your problem is, or share some code?</div><div><br></div><div>Jose</div></div></div>