<div dir="ltr">On Wed, Dec 28, 2016 at 3:30 AM, Dario Beraldi <span dir="ltr"><<a href="mailto:dario.beraldi@gmail.com" target="_blank">dario.beraldi@gmail.com</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>First, thanks for the great Biojava project!</div><div><br></div><div>Is it possible to parse embl files using (Bio)Java? </div><div><br></div><div>By Googling "biojava  embl format" I get some hits for the legacy Biojava 1.9 but I'm wondering weather I could (should?) use the more recent Biojava 4?</div></div></blockquote><div><br></div><div>If biojava-legacy works fine for you, feel confident using it.  It is actively maintained; there just won't be any new features.<br><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>A more general question... Which is the primary source of documentation for Biojava 4? Is it the tutorial at <a href="https://github.com/biojava/biojava-tutorial" target="_blank">https://github.com/biojava/<wbr>biojava-tutorial</a> together with the Javadocs (<a href="http://biojava.org/docs/api4.2.1/" target="_blank">http://biojava.org/docs/api4.<wbr>2.1/</a>)? </div><div><br></div><div>I find the home page Biojava.org a little confusing... The tutorial page <a href="http://biojava.org/wiki/BioJava:CookBook4.0/" target="_blank">http://biojava.org/wiki/<wbr>BioJava:CookBook4.0/</a> gives me a 404 error. The wiki pages <a href="http://biojava.org/wiki.html" target="_blank">http://biojava.org/wiki.<wbr>html</a> seem a mixture of various topics.</div></div></blockquote><div><br></div><div>The <a href="http://biojava.org">biojava.org</a> website didn't survive a wiki migration to github without running into some problems.  If you find any, please file them as issues at<br><br><a href="https://github.com/biojava/biojava.github.io">https://github.com/biojava/biojava.github.io<br></a><br></div>   michael<br></div></div></div>