<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Khalil<br>
    <br>
    How exactly are you developing/deploying your application? Do you
    use maven? Have you included any log4j2 configuration file at all?<br>
    <br>
    You can surely always add a log4j2.xml config file to your project,
    in there you can modify any logging configuration either for biojava
    or any other part of your code that uses log4j2.<br>
    <br>
    [biojava uses slf4j (a meta-logging framework which can use many
    underlying implementations) and then log4j2 as the default
    implementation ]<br>
    <br>
    Jose<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 28.08.2015 17:33, Khalil EL MAZOUARI
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
      cite="mid:67398B9A-169D-45E0-998C-C0FD4CFE1502@antibody-extractor.com"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      Hi,
      <div><br>
      </div>
      <div>when I add biojava-alignment-4.1.0 and biojava-phylo-4.1.0 to
        my app, my logging level changes and is set by default to WARN.</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Any idea how ‘override’ the logging level from biojava-4?</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Thanks</div>
      <div>
        <div>
          <div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Menlo;
            font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal;
            font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height:
            normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent:
            0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
            word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto;
            -webkit-text-stroke-width: 0px; "><br
              class="Apple-interchange-newline">
            <br>
          </div>
          <div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Menlo;
            font-style: normal; font-variant: normal; font-weight:
            normal; letter-spacing: normal; line-height: normal;
            orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px;
            text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
            word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto;
            -webkit-text-stroke-width: 0px; "><br>
          </div>
          <div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Menlo;
            font-style: normal; font-variant: normal; font-weight:
            normal; letter-spacing: normal; line-height: normal;
            orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px;
            text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
            word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto;
            -webkit-text-stroke-width: 0px; ">---</div>
          <div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Menlo;
            font-style: normal; font-variant: normal; font-weight:
            normal; letter-spacing: normal; line-height: normal;
            orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px;
            text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
            word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto;
            -webkit-text-stroke-width: 0px; ">
            <div style="margin: 0px; font-size: 13px; font-family:
              Helvetica; color: rgb(149, 149, 149); ">Confidentiality
              Notice: This e-mail and any files transmitted with it are
              private and confidential and are solely for the use of the
              addressee. It may contain material which is legally
              privileged. If you are not the addressee or the person
              responsible for delivering to the addressee, please notify
              that you have received this e-mail in error and that any
              use of it is strictly prohibited. It would be helpful if
              you could notify the author by replying to it.</div>
          </div>
        </div>
        <br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Biojava-l mailing list  -  <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Biojava-l@mailman.open-bio.org">Biojava-l@mailman.open-bio.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biojava-l">http://mailman.open-bio.org/mailman/listinfo/biojava-l</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>